1. 避免直視 LED 光源：螢光激發光（特別是紫光或藍光 LED）屬於高能量短波光，請絕對避免肉眼直視，以免損傷視網膜。

2. 抗螢光觀察方式：若還不熟悉操作方法時，建議配戴「橘色護目鏡」或者是「紅色護目鏡」（如上圖），或者以「遮光罩」的觀察方式。

3. 避免樣本過度曝光：長時間照射螢光樣本會導致光漂白（Photobleaching），導致螢光信號減弱甚至消失。可使用間歇性觀察或降低 LED 光強度進行拍攝。

4. 確保暗室環境：進行螢光觀察時，在一般的環境觀察時，一樣會有螢光反應，只是比較不明顯；若在暗室或遮光環境中操作，可降低背景光干擾。